Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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HOXD10P28358 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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