Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 457.2 ms