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| CHD4 | Q14839 | ZNF248-209 | ENST00000615949 | 518 nt | TSL 5 BASIC | 7.51 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | SLC35A3-207 | ENST00000533028 | 14759 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.51 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | MBD5-201 | ENST00000404807 | 5920 nt | TSL 5 BASIC | 7.51 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | PRNCR1-201 | ENST00000635449 | 12727 nt | BASIC | 7.51 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | TTTY15-202 | ENST00000440408 | 5284 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.51 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC007620.2-201 | ENST00000600539 | 1697 nt | TSL 5 BASIC | 7.51 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | DAZ3-202 | ENST00000382365 | 3503 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 7.51 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | RRS1-AS1-201 | ENST00000499642 | 4366 nt | TSL 2 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZEB2-244 | ENST00000638007 | 9140 nt | TSL 5 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | DPH5-204 | ENST00000427040 | 609 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AC011603.3-201 | ENST00000549516 | 279 nt | TSL 3 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | ZNF738-205 | ENST00000597810 | 747 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC133644.2-201 | ENST00000608142 | 540 nt | BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | ZEB2-241 | ENST00000637304 | 9158 nt | TSL 5 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | SSBP2-201 | ENST00000320672 | 8780 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | CFAP70-202 | ENST00000340329 | 1403 nt | TSL 5 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR51I2-202 | ENST00000641930 | 3302 nt | APPRIS P1 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | PHEX-AS1-201 | ENST00000424650 | 1906 nt | TSL 2 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | TGFBR3-202 | ENST00000370399 | 4550 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | DSG3-201 | ENST00000257189 | 5525 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | NDRG3-204 | ENST00000373803 | 2978 nt | TSL 5 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR1M1-202 | ENST00000641627 | 2535 nt | APPRIS P1 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF585A-202 | ENST00000356958 | 6822 nt | TSL 2 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | CD84-201 | ENST00000311224 | 1116 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC097721.1-201 | ENST00000427150 | 1253 nt | BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC02476-202 | ENST00000431071 | 559 nt | TSL 4 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL731661.2-201 | ENST00000448824 | 806 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AC005832.1-201 | ENST00000544380 | 572 nt | TSL 4 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | ELSPBP1-206 | ENST00000619003 | 893 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | LPAR6-201 | ENST00000345941 | 2428 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL14-201 | ENST00000338970 | 7072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF121-202 | ENST00000586602 | 7177 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 7.5 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL391261.1-201 | ENST00000555712 | 1479 nt | BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | PRKCA-202 | ENST00000413366 | 8751 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | OLFM4-201 | ENST00000219022 | 2897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | CD109-201 | ENST00000287097 | 9130 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | MAP4K4-206 | ENST00000413150 | 6958 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | MYBPC1-223 | ENST00000553190 | 3777 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | NCKAP1L-201 | ENST00000293373 | 9016 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | GAGE1-204 | ENST00000619375 | 2873 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | NUP107-211 | ENST00000539906 | 3004 nt | TSL 2 BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | KIAA1549L-201 | ENST00000265654 | 4492 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | TRPS1-203 | ENST00000395715 | 9990 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | ATF7IP2-204 | ENST00000396560 | 3665 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | MPP5-204 | ENST00000555925 | 5006 nt | TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | ERRFI1-202 | ENST00000467067 | 2097 nt | TSL 2 BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
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| CHD4 | Q14839 | LINC01748-203 | ENST00000634836 | 3229 nt | TSL 5 BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZMYND8-206 | ENST00000372023 | 5144 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC022034.1-201 | ENST00000512867 | 2156 nt | BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | CEACAM1-207 | ENST00000403444 | 3427 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | ZNF735-201 | ENST00000429565 | 1570 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 7.49 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | TSHR-201 | ENST00000298171 | 4400 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | SPRR2B-201 | ENST00000368755 | 617 nt | APPRIS P1 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | DAOA-202 | ENST00000375936 | 742 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | RPL17P50-201 | ENST00000396131 | 546 nt | BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL353626.3-201 | ENST00000413399 | 657 nt | BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AP001476.3-201 | ENST00000429512 | 415 nt | TSL 3 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC126120.1-201 | ENST00000431082 | 470 nt | BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC016712.1-201 | ENST00000431088 | 378 nt | BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL031123.1-201 | ENST00000432823 | 568 nt | TSL 2 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR4435-2HG-209 | ENST00000441075 | 704 nt | TSL 5 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC02485-202 | ENST00000511899 | 770 nt | TSL 3 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC040970.1-202 | ENST00000517908 | 505 nt | TSL 3 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | DERA-209 | ENST00000532964 | 854 nt | TSL 5 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC025278.1-201 | ENST00000593558 | 515 nt | TSL 2 BASIC | 7.48 | □□□□□ -1.21 | | |