Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316.4 ms