Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FRMPD4-202ENST00000616992 7916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CENPFP49454 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms