Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HOXD12P35452 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HOXD12P35452 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HOXD12P35452 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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HOXD12P35452 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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