Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC006017.1-201ENST00000424630 673 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL590369.1-201ENST00000455074 470 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PRR13P4-201ENST00000577786 421 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MYRFL-203ENST00000547771 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL109811.1-201ENST00000452378 2682 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC241585.4-201ENST00000640951 686 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CLCN3P1-202ENST00000609203 1944 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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