Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FBN2-204ENST00000508053 11132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SLC24A4-201ENST00000393265 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZAN-205ENST00000613979 8669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SALL1-201ENST00000251020 5146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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