Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms