Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CHTF8P1-201ENST00000414660 1541 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SGK3-202ENST00000396596 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096636.1-201ENST00000625140 3618 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TULP3-201ENST00000397132 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L2-202ENST00000324472 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TIGIT-203ENST00000481065 3710 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C4orf46-201ENST00000379205 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KLF17-201ENST00000372299 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010307.3-202ENST00000515122 3142 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP2-201ENST00000070846 4241 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms