Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.9 ms