Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
GAPVD1Q14C86 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms