Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms