Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 COMMD9-201ENST00000263401 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SPEF2-201ENST00000282469 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMP2-202ENST00000536189 3415 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC132008.1-201ENST00000394682 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01135-201ENST00000419531 996 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS27P12-201ENST00000464146 258 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MBL1P-202ENST00000497731 758 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001972.2-201ENST00000529304 216 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PROSER3-207ENST00000537459 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC120114.5-201ENST00000562285 556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL712P-201ENST00000579354 308 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009955.3-201ENST00000596829 448 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1D-13-201ENST00000611391 376 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.3-201ENST00000613268 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100835.2-201ENST00000617850 479 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL10-201ENST00000293303 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006946.2-201ENST00000608373 2855 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL8-229ENST00000545558 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00494-201ENST00000416742 3544 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms