Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
NEDD1Q8NHV4 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms