Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PSMD6Q15008 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms