Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 BTN2A3P-204ENST00000466808 2559 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 THBS3-201ENST00000368378 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 RAD17-219ENST00000521422 2323 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 NUDT13-207ENST00000544879 2258 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CAMSAP2-203ENST00000413307 4498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC009021.2-201ENST00000567401 1666 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ZNF80-203ENST00000619534 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 SULT1C2-201ENST00000251481 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 SNRNP40-202ENST00000373720 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 RNVU1-7-201ENST00000383858 164 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 HCG18-234ENST00000413358 916 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AL772284.1-201ENST00000443421 905 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 LINC01937-201ENST00000448543 553 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AL050327.1-201ENST00000525424 507 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC078905.1-201ENST00000560803 509 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC103949.1-201ENST00000582064 457 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 FAM95B1-209ENST00000590863 789 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AL669942.1-201ENST00000611307 713 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 BX510359.8-201ENST00000617713 296 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 SNX20-203ENST00000423026 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 PDZPH1P-201ENST00000412514 1783 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CDY15P-201ENST00000421995 1570 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 MSL3-202ENST00000337339 3446 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AC018682.1-201ENST00000506009 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ZNF35-202ENST00000396056 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 AL354740.1-201ENST00000586726 2681 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 VSIG4-201ENST00000374737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 FASTKD2-202ENST00000402774 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 JAKMIP2-AS1-201ENST00000626945 1920 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 PABPC1L-203ENST00000217075 670 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 TSSK4-201ENST00000287913 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 DEFA5-201ENST00000330590 449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
CAMK2BQ13554 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms