Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 OXNAD1-207ENST00000606098 2288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 THADA-205ENST00000404790 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TNFRSF10D-201ENST00000312584 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 COG2-201ENST00000366668 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC02292-201ENST00000554522 1701 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SP140L-201ENST00000243810 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF714-210ENST00000620627 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CALCOCO2-215ENST00000509507 1512 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CA5B-204ENST00000454127 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TRBV10-1-201ENST00000390364 412 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
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