Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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COL24A1Q17RW2 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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COL24A1Q17RW2 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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COL24A1Q17RW2 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL24A1Q17RW2 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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