Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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