Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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