Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ASAP1-IT2-201ENST00000626977 2031 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC011369.1-201ENST00000517408 2181 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AP002856.4-201ENST00000441638 569 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RPS6P25-201ENST00000464444 748 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC027607.1-201ENST00000503034 534 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC079384.1-201ENST00000548506 600 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AF127936.2-201ENST00000455253 1724 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MSX1P28360 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MSX1P28360 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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