Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SLC12A9Q9BXP2 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SLC12A9Q9BXP2 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms