Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MRNIP-204ENST00000518219 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL161725.1-201ENST00000591577 1351 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 COL25A1-208ENST00000610288 4799 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CNR1-204ENST00000428600 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ASB8-205ENST00000536549 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 FAM182A-201ENST00000376398 5070 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AP003025.2-202ENST00000414466 4335 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01427-204ENST00000635299 1978 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZBTB14-207ENST00000614697 3341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 HMGCLL1-201ENST00000274901 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL133230.1-201ENST00000431019 4587 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RCAN1-208ENST00000482533 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 C8orf44-201ENST00000390159 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC009948.1-205ENST00000453026 2007 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01299-201ENST00000520902 2634 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZSCAN32-201ENST00000304926 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL731563.3-201ENST00000608005 3005 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CFAP58-202ENST00000369704 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL591896.1-201ENST00000420211 491 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TMED10P2-201ENST00000474255 612 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 C1orf186-208ENST00000603378 614 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC241585.4-201ENST00000640951 686 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL451074.2-201ENST00000423121 2150 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SPATA31E3P-201ENST00000613133 4214 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC02072-201ENST00000441895 2645 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 DCN-220ENST00000552962 1930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ELAVL2-203ENST00000380117 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CD36-209ENST00000435819 2365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms