Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms