Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms