Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TTC7AQ9ULT0 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms