Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms