Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC098679.2-201ENST00000513067 365 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL132855.1-201ENST00000557368 207 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CASC15-205ENST00000606336 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC006238.1-201ENST00000609787 534 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC040978.1-201ENST00000617244 1282 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CCT5P1-201ENST00000502314 1618 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GSTM2-204ENST00000369831 1730 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NOL4-201ENST00000261592 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 C11orf70-201ENST00000434758 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 FLT1-203ENST00000540678 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NLRP5-201ENST00000390649 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF185-204ENST00000370268 4305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SLC8A1-209ENST00000408028 2898 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 BBS9-202ENST00000350941 3899 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SYT14-202ENST00000367019 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SYNPR-201ENST00000295894 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TMEM106A-208ENST00000612339 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 RPS27P12-201ENST00000464146 258 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 RN7SL201P-201ENST00000482306 296 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN3Q13064 RN7SL869P-201ENST00000497032 300 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AP003354.1-201ENST00000523791 533 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AL162311.2-201ENST00000550416 709 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC007998.3-202ENST00000591141 697 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN3Q13064 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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