Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC156455.1-202ENST00000540968 587 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL079352.1-201ENST00000547237 1042 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC004816.1-202ENST00000557691 629 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL783P-201ENST00000577950 301 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 UBBP4-201ENST00000583708 689 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 APOC4-APOC2-202ENST00000589057 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SQSTM1P1-201ENST00000603451 859 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC008555.5-201ENST00000603718 515 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP357-201ENST00000607318 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.142-201ENST00000612810 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC125257.2-201ENST00000619176 156 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 EAF1-AS1-212ENST00000626521 561 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-203ENST00000631484 754 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-230ENST00000633592 568 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TRIM53AP-201ENST00000532014 1544 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL731537.1-201ENST00000343087 421 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CLLU1OS-201ENST00000378487 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IGLV2-14-201ENST00000390312 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TRAV3-201ENST00000390425 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 EPSTI1-203ENST00000398762 957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DDX11L5-201ENST00000421620 654 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC108868.1-201ENST00000431411 554 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms