Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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