Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PRNT-203ENST00000423718 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RFPL4B-201ENST00000441065 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC009044.1-201ENST00000624577 1798 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 UGT2B7-203ENST00000508661 1633 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ZNF322-201ENST00000415922 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 DDX11L16-201ENST00000507418 1306 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PRR27-201ENST00000344526 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CD59-203ENST00000415002 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PPFIA2-216ENST00000549396 5363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CLUHP3-206ENST00000562354 4117 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPL21P88-201ENST00000436649 436 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GGT3P-203ENST00000445651 368 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 PHYKPL-205ENST00000476170 824 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CACNA1D-202ENST00000350061 7636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC117945.2-201ENST00000642109 1521 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ERMAP-202ENST00000372514 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 EIF4BP2-201ENST00000416702 1794 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GABRA1-219ENST00000638112 2818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TBC1D8B-201ENST00000276175 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL031118.1-201ENST00000607727 2955 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ITIH4-201ENST00000266041 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC114980.1-201ENST00000505668 3157 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL354740.1-201ENST00000586726 2681 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL662907.3-201ENST00000641271 1932 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ARHGEF9-237ENST00000638021 3876 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 NOS1-203ENST00000344089 4340 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ARL6IP5-201ENST00000273258 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 GHRHR-204ENST00000409316 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 OR2L6P-201ENST00000416377 940 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 ASS1P5-201ENST00000435496 1239 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 RPSAP76-201ENST00000444599 853 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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