Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC00486-202ENST00000424364 691 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC084851.3-201ENST00000432771 573 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC01716-201ENST00000434176 698 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZEB2-214ENST00000462355 656 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZNF595-202ENST00000509152 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC124276.2-201ENST00000527997 550 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 GS1-24F4.2-202ENST00000531701 380 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP001453.2-202ENST00000538355 431 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC02304-201ENST00000554445 445 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC025280.1-201ENST00000562393 260 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 APCDD1-203ENST00000578882 559 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CTBP1-219ENST00000629223 210 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC093426.1-201ENST00000561926 3011 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PAX4-208ENST00000639438 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TCF4-209ENST00000544241 2264 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 C9orf85-206ENST00000486911 3321 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PLA2G4D-201ENST00000290472 3584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NCALD-202ENST00000311028 3655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ILK-210ENST00000528995 1559 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PAX6-246ENST00000638963 1580 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 DCBLD2-202ENST00000326857 3959 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MGLL-203ENST00000398104 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC005538.2-201ENST00000623215 1864 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 CD28-202ENST00000374481 4526 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZFAT-201ENST00000377838 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LMX1A-201ENST00000294816 3350 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TMEM161B-213ENST00000514135 2035 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 HLA-V-203ENST00000457107 4814 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 FMO1-201ENST00000354841 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL451074.2-201ENST00000423121 2150 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 USP35-201ENST00000526425 3770 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP000533.2-201ENST00000417863 2260 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PCDHB12-201ENST00000239450 3853 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SCN5A-207ENST00000449557 5898 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC00488-201ENST00000494582 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 NDUFB4P3-201ENST00000418418 390 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AL138881.1-201ENST00000443445 789 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 KRTAP19-10P-201ENST00000445258 187 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC020978.1-201ENST00000465542 337 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP000424.1-202ENST00000523831 331 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP002957.1-201ENST00000525952 406 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC02301-202ENST00000555150 428 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RNASE12-201ENST00000556526 631 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC024270.3-201ENST00000565513 396 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 LINC00511-204ENST00000577828 538 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC006441.2-201ENST00000580084 302 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 RN7SL378P-201ENST00000582657 298 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 ARNT2-201ENST00000303329 6558 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
HOXD11P31277 TRPS1-211ENST00000520276 4083 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PDP2-201ENST00000311765 7146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SLC24A1-202ENST00000339868 5678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 COL14A1-203ENST00000309791 6163 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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