Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PKHD1P08F94 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 POU6F1-202ENST00000389243 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms