Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ZBED1O96006 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ZBED1O96006 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms