Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SNX13Q9Y5W8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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