Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms