Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLDN16Q9Y5I7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms