Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KNSTRNQ9Y448 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KNSTRNQ9Y448 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms