Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRELID3BQ9Y3B1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms