Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR3KQ9Y2Y1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms