Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM2AQ9Y2K7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms