Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms