Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SHANK2Q9UPX8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHANK2Q9UPX8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms