Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF9BQ9UPX0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF9BQ9UPX0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms