Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGTPBP1Q9UPW5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms