Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAF8Q9UPN6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAF8Q9UPN6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms