Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHA12Q9UN75 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms