Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MKLN1Q9UL63 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms