Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO3Q9UK99 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms